אנטון קסטיליו עלה לשלטון בהבטחה לשחזר את תפארתה של אומת היארה שנפלה מגדולתה, ומתכנן לזייף את חזונו לגן עדן בכל האמצעים הנחוצים.
עם בנו בן ה -13 דייגו לצידו, עתידה של יארה, אשר שוכנת בלב האיים הקאריביים, גן עדן טרופי קפוא בזמן, נמצא בידי אנטון.

עשורים של סנקציות כלכליות הרסו את האומה, והותירה אותה ענייה וחצויה ובזמן שחלק נאמנים לאנטון באופן עיוור, אחרים מצאו עצמם משועבדים בשם רעיון שחזור גן-העדן.
כאשר האכזריות של שלטונו מגיעה לשיא, הזעם וההתקוממות ניצתים ברחבי המדינה.
ב Far Cry 6, השחקנים ישקעו בעולם מלא אדרנלין וכאוטי של מהפכה בעידן המודרני.
הוליכו את עוקביו של אנטון בקרב אינטנסיבי דרך הג'ונגל השופע וערים צפופות כמו דני רוחאס.